编制合并会计报表是会计工作中的难中之重。主要表现为：首先需要准确判断应该纳入合并的企业范围。其次是合并分录的编制，合并分录必须进行全面编制。具体包括：编制合并资产负债表和利润表时进行的母、子公司及子公司间长期股权投资与所有者权益及相应的长期股权投资减值准备的抵销；债权、债务项目及相关坏账准备或相关减值准备间的相互抵销；销售商品（或提供劳务）或其他方式形成的存货、固定资产、工程物资、在建工程和无形资产等所包含的未实现内部销售损益及对这部分资产计提的跌价准备或减值准备；投资收益与发行方利息费用的抵销；投资收益之间的抵销；其他内部交易的抵销等；还包括编制合并现金流量表时，母、子公司间及子公司相互之间当期以现金投资或收购股权增加的投资所产生的现金流量的抵销；当期取得投资收益时收到的现金与分配股利、利润或偿付利息支付的现金的相互抵销；以现金结算债权与债务所产生的现金流量的抵销；当期销售商品所产生的现金流量的抵销；处置固定资产、无形资产和其他长期资产收回的现金净额与购建固定资产、无形资产和其他长期资产支付的现金的相互抵销；当期发生的其他内部交易所产生的现金流量的抵销。
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需要注意的是，在购买日抵销时产生的差额的处理中，要区分同一控制下的企业合并和非同一控制下的企业合并两种不同企业合并类型进行不同的处理。如在同一控制下的企业合并中，长期股权投资的初始投资成本与所发行股份的面值总额之间的差额，一般应当调整资本公积；资本公积不足冲减的，调整留存收益。非同一控制下的企业合并中，长期股权投资与所有者权益抵销的差额应计入商誉、债券投资与应付债券抵销的差额应计入投资收益项目。
